Der bne-Vorstand führt die Geschäfte des Verbands im Auftrag der Mitgliederversammlung. Von der Erzeugung über die Flexibilisierung bis hin zur Vermarktung deckt der bne das gesamte Spektrum der neuen Energiewirtschaft ab. Diese Themenbreite spiegelt sich auch im bne-Vorstand wider. Vorsitzende des bne-Vorstands ist Dr. Kirsten Nölke (Naturstrom AG). Ihre Stellvertreter sind Dr. Holger Krawinkel (MaxSolar GmbH) und Gero Lücking (Techem Solutions GmbH). Dem Vorstand gehören außerdem Anja Burde (EWS Elektrizitätswerke Schönau eG),  Silvia Fischer (Beegy GmbH), Fabian Hafner (1KOMMA5° GmbH),  Daniel Hölder (BayWa r.e. AG), Dr. Tim Meyer (3EPunkt/Bürgerwerke eG) und Marc Wallraff (LichtBlick SE) an.

Die Mitgliederversammlung ist das höchste beschlussfassende bne-Organ. Mindestens einmal pro Jahr kommen die Mitgliedsunternehmen zusammen und treffen grundsätzliche Entscheidungen. Mitglieder können ihre Vorschläge zur Tagesordnung und Anträge an die Versammlung bis spätestens eine Woche vor dem Termin schriftlich beim Vorstand vorbringen. Über Tagesordnungspunkte und Anträge, die nicht mit der Tagesordnung angekündigt worden sind, kann abgestimmt werden – wenn und soweit sich die Mehrheit der anwesenden Mitglieder dafür ausspricht und die Dringlichkeit der Sache sieht. Für die Mitglieder ist die Versammlung außerdem eine gute Gelegenheit zum Netzwerken.